Cell line name | Ishikawa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | ISHIKAWA; ISHI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Ishikawa (RRID:CVCL_2529) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Japanese. Doubling time: 36 hours (Note=At 9th passage), 29 hours (Note=At 40th passage), 27 hours (Note=At 50th passage) (DOI=10.1007/978-4-431-53981-0_2); 35.14 +- 2.68 hours (PubMed=23255909). Omics: Array-based CGH. Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Misspelling: Ischikawaa; Note=Occasionally. Derived from site: In situ; Endometrium; UBERON=UBERON_0001295. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Disease | Endometrial adenocarcinoma (NCIt: C7359) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 39Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ECACC; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/Ishikawa_Crawford_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4031568 PubMed=10381137; DOI=10.1016/s0304-3835(98)00270-5 PubMed=12703541; DOI=10.1111/j.1749-0774.2002.tb00105.x DOI=10.1007/978-4-431-53981-0_2 PubMed=15053063 PubMed=15901131; DOI=10.1016/j.prp.2005.01.002 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=20218740; DOI=10.1177/153303461000900207 PubMed=20944090; DOI=10.1126/scitranslmed.3001538 PubMed=22710073; DOI=10.1016/j.ygyno.2012.06.017 PubMed=23255909; DOI=10.3892/ol.2012.975 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCRID; 1101HUM-PUMC000686 Cell_Model_Passport; SIDM00038 LINCS_HMS; 50018 LINCS_LDP; LCL-1497 TOKU-E; 3966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471030 ENCODE; ENCBS228AAA ENCODE; ENCBS229AAA ENCODE; ENCBS230AAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | BCRJ; 0364 ECACC; 99040201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307675 ChEMBL-Targets; CHEMBL614649 PharmacoDB; Ishikawa_667_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54898281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005718 |