Cell line name | JAR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Jar; JAr; JaR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | BTCC-1083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: JAR (BTCC-1083) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: ~20-30 hours (DSMZ=ACC-462). Karyotypic information: Near triploid karyotype (PubMed=33096371). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Caution: Established from the trophoblastic tumor of the placenta of a 24 year old woman, but the cell line is from the male fetus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gestational choriocarcinoma (NCIt: C4646) Gestational choriocarcinoma (ORDO: Orphanet_99926) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Fetus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CLS; Cosmic-CLP; DSMZ; KCLB Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1007/BF02619074 PubMed=7153601 PubMed=4038916; DOI=10.1016/0165-4608(85)90052-4 PubMed=2878840; DOI=10.1016/0020-7292(86)90088-3 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=2720636; DOI=10.1016/0165-4608(89)90664-X PubMed=7937597; DOI=10.1016/0143-4004(94)90008-6 PubMed=7716126; DOI=10.1016/0143-4004(95)90079-9 PubMed=7819056; DOI=10.1038/bjc.1995.3 DOI=10.1007/0-306-46861-1_8 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=24098444; DOI=10.1371/journal.pone.0076205 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28161053; DOI=10.1016/j.placenta.2016.12.007 PubMed=28724925; DOI=10.1038/s41598-017-06364-z PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=33096371; DOI=10.1016/j.placenta.2020.10.011 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007011 MCCL; MCC:0000254 CCRID; 3101HUMTCHu156 Cell_Model_Passport; SIDM01039 Cosmic-CLP; 907175 DepMap; ACH-001529 DSMZCellDive; ACC-462 IGRhCellID; JAR LINCS_LDP; LCL-1491 TOKU-E; 2064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821568 BioSample; SAMN01821637 BioSample; SAMN03472717 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-144 BCRC; 60491 CLS; 300221 DSMZ; ACC-462 IZSLER; BS TCL 182 KCLB; 30144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307657 ChEMBL-Targets; CHEMBL614587 GDSC; 907175 PharmacoDB; JAR_676_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54898511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38 ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827264 GEO; GSM1669947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907175 Cosmic; 2077193 IARC_TP53; 21417 Progenetix; CVCL_0360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 |