Cell line name | D341 Med | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | D-341 Med; D-341 MED; D-341 Med-C; D-341Med; D-341MED; D341_Med; D341Med; D341MED; D341MD; D-341; D341; Med 341; H341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | BTCC-1210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: D341 Med (BTCC-1210) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Caucasian. Doubling time: 37 hours (ATCC=HTB-187). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Transcriptome analysis by serial analysis of gene expression (SAGE). Miscellaneous: The values for the STR markers F13A01, F13B, FESFPS and LPL used to be shown on the ATCC website but are no longer displayed (see Internet archive link for archival version). Derived from site: In situ; Brain, cerebellum; UBERON=UBERON_0002037. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Medulloblastoma, non-WNT/non-SHH, group 3 (NCIt: C129445) Medulloblastoma (ORDO: Orphanet_616) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3Y5M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CCRID Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/MedulloD341_Crawford_protocol.pdf https://web.archive.org/web/20160611152450/http://www.atcc.org:80/products/all/HTB-187.aspx#specifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3279793 PubMed=2180567 PubMed=1822845 PubMed=8275086; DOI=10x.1038/ng1193-230 DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=20847082; DOI=10.1093/neuonc/noq091 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=27498314; DOI=10.1016/j.jbiotec.2016.07.028 PubMed=27812533; DOI=10.1016/j.dib.2016.10.004 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31963405; DOI=10.3390/cancers12010226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002677 CCRID; 1101HUM-PUMC000102 Cell_Model_Passport; SIDM01492 DepMap; ACH-000095 IGRhCellID; D341Med | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472737 BioSample; SAMN10988120 ENCODE; ENCBS254AAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-187 CLS; 305136 KCB; KCB 2010239YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308450 ChEMBL-Targets; CHEMBL614478 PharmacoDB; D341Med_280_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54817217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002157 |