Cell line name | A-549 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | A 549; A549; NCI-A549; A549/ATCC; A549 ATCC; A549ATCC; hA549 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | BTCC-1012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | BTCC-1012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: A-549 (BTCC-1012) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 2. Part of: JFCR39 cancer cell line panel. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Part of: NCI-60 cancer cell line panel. Part of: NCI-7 clinical proteomics reference material cell line panel. Registration: International Depositary Authority, Japanese National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology; FERM BP-2000. Population: Caucasian. Virology: Highly susceptible to infection by Zika virus (ZIKV) (PubMed=29468137). Doubling time: 18 hours (Note=In RPMI 1640 + 10% FBS), 37 hours (Note=In ACL-3), 36 hours (Note=In ACL-3+BSA) (PubMed=3940644); 27.0 hours (PubMed=8286010); 22 hours (PubMed=25984343); 23.9 hours (PubMed=29681454); 27 hours (Note=From cell counting), 27 hours (Note=From absorbance) (DOI=10.5897/IJBMBR2013.0154); 26.08 hours (PubMed=35976051); ~28 hours (CLS=300114); ~40 hours (DSMZ=ACC-107); 22.9 hours (NCI-DTP=A549). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=12661003; Sanger). Omics: Acetylation analysis by proteomics. Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: CTCF ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Deep antibody staining analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep membrane proteome analysis. Omics: Deep phosphoproteome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Fluorescence phenotype profiling. Omics: lncRNA expression profiling. Omics: Metabolome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: Proteome analysis by 2D-DE/MS. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Virome analysis using proteomics. Misspelling: A59; PubMed=16354588. Misspelling: A594; PubMed=18227028; Note=In abstract. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=77569
Source: PubMed=15748285
Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=9023415
Source: PubMed=26589293
Source: CLS=300114
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio; ATCC; CCRID; CLS; Cosmic-CLP; DSMZ; ECACC; Genomics_Center_BCF_Technion; JCRB; KCLB; PubMed=19372543; PubMed=25877200; RCB; TKG Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://en.wikipedia.org/wiki/A549_cell http://www.a549.com/ https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/morphology-of-ccl-185 https://dtp.cancer.gov/discovery_development/nci-60/cell_list.htm https://strap.nci.nih.gov/celline_detail.php?sample_id=8 http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/A549_protocol.pdf https://www.proteinatlas.org/learn/cellines http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=CCL-185 https://en.vircell.com/products/a-549-cell-line/ https://micro.magnet.fsu.edu/primer/techniques/fluorescence/gallery/cells/a549/a549cells.html https://www.olympus-lifescience.com/de/microscope-resource/primer/techniques/fluorescence/gallery/cells/epithelialindex/ https://www.microscopyu.com/gallery-images/male-human-lung-carcinoma-epithelial-cells-a-549-line https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/a/cell-lines-detail-58.html http://141.61.102.20/mxdb/project/show/9191407937500 https://tcpaportal.org/mclp/ https://www.phe-culturecollections.org.uk/media/126404/a549-cell-line-profile.pdf | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4357758; DOI=10.1093/jnci/51.5.1417 PubMed=175022; DOI=10.1002/ijc.2910170110 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=842942; DOI=10.1164/arrd.1977.115.2.285 PubMed=924690; DOI=10.1002/ijc.2910200505 PubMed=77569; DOI=10.1111/j.1399-0039.1978.tb01259.x PubMed=375235; DOI=10.1073/pnas.76.3.1288 PubMed=6256643; DOI=10.1038/288724a0 PubMed=22282976; DOI=10.1093/carcin/1.1.21 PubMed=6935474; DOI=10.1093/jnci/66.2.239 PubMed=7459858 PubMed=6954533; DOI=10.1073/pnas.79.7.2194 PubMed=7065527; DOI=10.1164/arrd.1982.125.2.222 PubMed=6825208; DOI=10.1093/carcin/4.2.199 PubMed=6148444; DOI=10.1093/jnci/73.4.801 PubMed=6500159; DOI=10.1159/000163283 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=3940644 PubMed=3945555; DOI=10.1093/nar/14.2.843 PubMed=3129183 PubMed=3335022 PubMed=3413074; DOI=10.1073/pnas.85.16.6042 PubMed=2388294; DOI=10.1093/jnci/82.17.1420 PubMed=1855224 PubMed=2041050; DOI=10.1093/jnci/83.11.757 PubMed=8286010 PubMed=8132585; DOI=10.1016/S0021-9258(17)37236-8 PubMed=7736387; DOI=10.1002/1097-0142(19950515)75:10<2442::aid-cncr2820751009>3.0.CO;2-Q PubMed=8626706; DOI=10.1074/jbc.271.19.11477 PubMed=9023415; DOI=10.1006/cimm.1996.1062 PubMed=9178645; DOI=10.1006/cimm.1997.1108 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::aid-mc5>3.0.CO;2-D PubMed=9538136; DOI=10.3892/ijo.12.5.1103 PubMed=9636188; DOI=10.1073/pnas.95.13.7556 PubMed=9649128; DOI=10.1038/bjc.1998.361 PubMed=10358721; DOI=10.18926/AMO/31626 PubMed=10536175; DOI=10.3892/ijo.15.5.927 PubMed=10700174; DOI=10.1038/73432 PubMed=11005564; DOI=10.1038/sj.neo.7900094 PubMed=11369051; DOI=10.1016/S0165-4608(00)00363-0 PubMed=11958134 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=12794755; DOI=10.1002/ijc.11184 PubMed=14581340 PubMed=15746151; DOI=10.1093/hmg/ddi092 PubMed=15748285; DOI=10.1186/1479-5876-3-11 PubMed=15900046; DOI=10.1093/jnci/dji133 PubMed=15999539 PubMed=17088437; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-06-0433 PubMed=17331233; DOI=10.1186/1471-2164-8-62 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001601 CLO; CLO_0050025 CLDB; cl202 CLDB; cl203 CLDB; cl204 CLDB; cl205 CLDB; cl206 CLDB; cl207 CLDB; cl5100 CLDB; cl7131 CCRID; 1101HUM-PUMC000002 CCRID; 1102HUM-NIFDC00008 CCRID; 3101HUMSCSP503 CCRID; 3101HUMTCHu150 CCRID; 4201HUM-CCTCC00063 CCRID; 5301HUM-KCB04034YJ Cell_Model_Passport; SIDM00903 CGH-DB; 202-1 CGH-DB; 9164-4 Cosmic-CLP; 905949 DepMap; ACH-000681 DSMZCellDive; ACC-107 FCS-free; 237-2-485-2-16-12 IGRhCellID; A549GEO LINCS_HMS; 50084 LINCS_LDP; LCL-1601 Lonza; 675 SKY/M-FISH/CGH; 2809 TOKU-E; 3615 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0000018 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sam | ENCODE; ENCBS013GXJ ENCODE; ENCBS013HGJ ENCODE; ENCBS013HOT ENCODE; ENCBS015HRP ENCODE; ENCBS016CUF ENCODE; ENCBS016ESU ENCODE; ENCBS016VTZ ENCODE; ENCBS017CJM ENCODE; ENCBS018TOF ENCODE; ENCBS021JVU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | Abcam; ab255450 Abcam; ab259777 Abcam; ab275463 Abcam; ab288558 AddexBio; C0016002/23 ATCC; CCL-185 ATCC; CRM-CCL-185 ATCC; CRL-7909 - Discontinued BCRC; 60074 BCRJ; 0033 BEI_Resources; NR-52268 CCLV; CCLV-RIE 1035 CCTCC; GDC0063 CLS; 300114 DSMZ; ACC-107 ECACC; 86012804 IBRC; C10080 IBRC; C10681 ICLC; HTL03001 IZSLER; BS TCL 101 JCRB; IFO50153 JCRB; JCRB0076 KCB; KCB 200434YJ KCLB; 10185 Kerafast; ESA114 NCBI_Iran; C137 NCI-DTP; A549 RCB; RCB0098 RCB; RCB3677 TKG; TKG 0184 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307651 ChEMBL-Targets; CHEMBL392 GDSC; 905949 PharmacoDB; A549_48_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q4649475 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0001086 |